Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNMA3Q9UL41 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNMA3Q9UL41 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms