Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDC42EP3Q9UKI2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms