Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX25Q9UHL0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX25Q9UHL0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms