Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIP2Q9UDT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIP2Q9UDT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms