Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COPS7AQ9UBW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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