Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK2Q9UBU2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms