Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XCL2Q9UBD3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms