Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNMT3BQ9UBC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNMT3BQ9UBC3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms