Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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