Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CLN6Q9NWW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLN6Q9NWW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms