Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOMER2Q9NSB8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOMER2Q9NSB8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms