Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELLSQ9NRZ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms