Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIAA1549Q9HCM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms