Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms