Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NIFKQ9BYG3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms