Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4AQ9BY43 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms