Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNHG12Q9BXW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms