Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3CQ9BUI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3CQ9BUI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms