Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms