Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CITED1Q99966 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms