Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf85Q96MD7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf85Q96MD7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms