Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD8Q96LT4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD8Q96LT4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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