Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPNS2Q96L46 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms