Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHACTR3Q96KR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms