Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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