Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHCHD4Q8N4Q1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD4Q8N4Q1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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