Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC2Q8N158 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC2Q8N158 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms