Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOA5Q6Q788 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOA5Q6Q788 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms