Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms