Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF6Q6KF10 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms