Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF38BQ5VTL8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms