Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BEND3Q5T5X7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BEND3Q5T5X7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms