Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CEP170Q5SW79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
CEP170Q5SW79 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CEP170Q5SW79 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CEP170Q5SW79 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms