Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms