Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00303Q3SY05 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00303Q3SY05 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms