Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TTLL9Q3SXZ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms