Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPEL1Q2QD12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms