Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDO1Q16878 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDO1Q16878 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDO1Q16878 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDO1Q16878 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CDO1Q16878 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDO1Q16878 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDO1Q16878 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDO1Q16878 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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