Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECM1Q16610 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECM1Q16610 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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