Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNA2Q15822 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA2Q15822 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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