Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NPTX1Q15818 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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