Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABEP1Q15276 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABEP1Q15276 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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