Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRKQ15262 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
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