Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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BRD3Q15059 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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BRD3Q15059 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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