Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPSQ13938 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPSQ13938 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms