Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ERCC8Q13216 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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