Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNL1Q0VF96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNL1Q0VF96 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms