Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms