Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTDSPL2Q05D32 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms