Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.92□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YMR317WYMR317W 3423 nt2.92□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 TAF2YCR042C 4224 nt2.92□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 DIS3YOL021C 3006 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 TFC1YBR123C 1950 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 snR76snR76 109 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 DLS1YJL065C 504 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 RGM1YMR182C 636 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 SPO14YKR031C 5052 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 CDC20YGL116W 1833 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 IPT1YDR072C 1584 nt2.91□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 CDC36YDL165W 576 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YGL024WYGL024W 336 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 ALG13YGL047W 609 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 VAS1YGR094W 3315 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 STE6YKL209C 3873 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DSE4YNR067C 3354 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DUF1YOL087C 3351 nt2.9□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YJL070CYJL070C 2667 nt2.89□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RLI1YDR091C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 ORC1YML065W 2745 nt2.89□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.89□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.89□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RPN1YHR027C 2982 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DBP6YNR038W 1890 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YDL062WYDL062W 426 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YIL102CYIL102C 306 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RPS27AYKL156W 249 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 LSM7YNL147W 348 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 SAK1YER129W 3429 nt2.88□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 PSK1YAL017W 4071 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 MPH1YIR002C 2982 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RTC6YPL183W-A 282 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DAD3YBR233W-A 285 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 NUP120YKL057C 3114 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DNL4YOR005C 2835 nt2.87□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 ARP7YPR034W 1434 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RGR1YLR071C 3249 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 snR49snR49 165 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 CHO2YGR157W 2610 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 CHS2YBR038W 2892 nt2.86□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RBK1YCR036W 1002 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 PHS1YJL097W 654 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 GRX8YLR364W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 SMA2YML066C 1110 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 MRPL33YMR286W 261 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 SAR1YPL218W 573 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 NAB3YPL190C 2409 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RCY1YJL204C 2523 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YTA7YGR270W 4140 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 NET1YJL076W 3570 nt2.85□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 NCL1YBL024W 2055 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RAD61YDR014W 1944 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 PHD1YKL043W 1101 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 SDH2YLL041C 801 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YLR294CYLR294C 330 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 ABF2YMR072W 552 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 RPL36AYMR194W 303 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 snR42snR42 351 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 DOT6YER088C 2013 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 ROG1YGL144C 2058 nt2.84□□□□□ -1.95
YKR011CQ02209 PFK26YIL107C 2484 nt2.84□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 TAO3YIL129C 7131 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 KSP1YHR082C 3090 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 MCD1YDL003W 1701 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 SGD1YLR336C 2700 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YFH1YDL120W 525 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YGL041CYGL041C 204 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YHL041WYHL041W 450 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YIL059CYIL059C 366 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 TSC11YER093C 4293 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 SNQ2YDR011W 4506 nt2.83□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 PTC5YOR090C 1719 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 BUD4YJR092W 4344 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YIL032CYIL032C 357 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YLR053CYLR053C 327 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YNL198CYNL198C 303 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 UBP11YKR098C 2154 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 FLO5YHR211W 3228 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 FUN30YAL019W 3396 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YPR089WYPR089W 2667 nt2.82□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YGL069CYGL069C 465 nt2.81□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YHL042WYHL042W 453 nt2.81□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 COG8YML071C 1824 nt2.81□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 HCS1YKL017C 2052 nt2.8□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 RIM20YOR275C 1986 nt2.8□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 DYN1YKR054C 12279 nt2.8□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YCK3YER123W 1575 nt2.8□□□□□ -1.96
YKR011CQ02209 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.3 ms